Lo ZooPlantLab è impegnato in numerosi progetti di ricerca italiani e internazionali che prevedono approcci integrati basati sia su metodologie classiche che su sistemi biomolecolari innovativi.

I campi di applicazione principali si riferiscono a:

- Valutazione della biodiversità, della ricchezza floristica e faunistica e della connettività ecologica

- Bioindicazione e biomarker: utilizzo di organismi animali e vegetali per il monitoraggio della qualità delle acque, dei suoli e dell'aria

- Evoluzione e Biologia dello sviluppo

- Studio delle interazioni tra organismi viventi: simbiosi e parassitismo

- sviluppo di sistemi diagnostici per il comparto agroalimentare e ambientale